1480’lerin sonunda, Botticelli’nin çalışmalarında, daha geniş bir kitleye hitap ediyormuş gibi büyük ölçekli kompozisyonlarla samimi bir oda planının dini görüntüleri değiştirildi. 1484-1489’da Botticelli kendisinden memnun görünüyorsa ve sakin bir ihtişam ve ustalık döneminden geçiyorsa, “San Marco Altar” zaten duyguların, yeni endişelerin ve umutların karışıklığına tanıklık ediyor. Bu resmin etkisinin gücü, büyük ölçüde kıyamet renklendirme ile dini ve sembolik motiflerle doyurulmuş göksel görüşün yorumlanmasından kaynaklanmaktadır. Onlar, Floransa’da Savonarola’nın vaaz edilmesinden esinlenerek, yakında 1494’te Medici’nin sürgününe son veren politik bir darbeye yol açtı.
Kararda, şimdi farklı tonlamalar daha fazla ses veriyor, keskin dramatik sesle dolu. Sandro’nun bu dönemin dini güdülerle ilgili çalışmalarının formatı genişletildi, bu da onlara yeni bir önem veriyor. Bu tür kompozisyonun tipik bir örneği, Botticelli’nin en çarpıcı eserlerinden biri olan San Marco Altar’dır.
Florentine Jewelers Guild, San Marco Dominik Kilisesi’nin bakım ve dekorasyonundan sorumluydu, kilisenin şapellerinden biri patronları Saint Eligius’a adanmıştı. 1488-1492 civarında Botticelli tarafından boyanan San Marco Sunağı olarak bilinen “Meryem’in Meleklerle Taç giymesi, Evanjelist John ve Aziz Augustine, Jerome ve Eligius” bu şapel için tasarlandı. Sunak imgesinin kuyumcular tarafından görevlendirilmesi, bu çalışmada büyük miktarlarda altın kullanımını açıklıyor. Resmin üstündeki altın arka plan göksel ve dünyevi dünyaları sınırlar, ancak yine de resmin uzayında temas kurarlar, o zamanki çalışmalar için böyle bir yorum olağandışıydı.
Sunağın merkezi kısmı arkaik özelliklerle işaretlenmiştir: meleklerin ve azizlerin figürleri ölçek bakımından keskin bir şekilde değişir; taç giyme sahnesinin çevrelendiği fantastik niş, dört ana karakterin uzamsal ortamının daha gerçekçi bir yorumuyla zıttır. Sevinçli meleklerle çevrili olan Baba Tanrı ve Meryem Ana, göğsünde tahtlarda, ayaklarının altında oturur – bir bulut halısı. Botticelli, şapelin kubbeli mimarisiyle tutarlı olan resmin yarım daire biçimli üst kısmındaki cennet ışımasını ustaca figürlerinden alıyor.
Dört anıtsal aziz figürü, bir göl ve engebeli kıyıları olan bir manzara fonunda çayırda yarım daire içinde bulunur. Müjde, Epistles ve Apocalypse’in yazarı, açık bir kitapla tasvir edilen elçi John, meleklerin gök mavisi gökkuşağı kemeri ve seraphim’in Mary’nin Taç giyme sahnesini çevreleyen fantastik dönüşü arasında bir arabulucu görevi görür. Meleklerin altın ışınların bir arka planına karşı, göz kamaştırıcı bir ışıltıda, gül yağmuru ve kayalarıyla karasal bir manzara ve azizlerin üzerinde durduğu ıssız bir çayır arasında ortaya çıkması, fantasmagorik çekici cennetsel gerçeklik ile maddi dünyanın zorlukları arasındaki kontrastı vurgulamaktadır.
Meleklerin imajında çok fazla heyecan var, Aziz Jerome’nun yeminli hareketi güven ve haysiyeti soluyor. Aynı zamanda, “oranların mükemmelliği” nden bir miktar ayrılma söz konusudur. Bu arada, sadece karakterlerin iç dünyasına atıfta bulunan ve bu nedenle büyüklük olmadan değil, rengin keskinliği artar ve chiaroscuro’dan daha bağımsız hale gelir.